1992年，注册成立平顶山市河南城专建筑规划设计所，注册资金20万元。办公地点位于湛北路原河南城建学院东校区（现平顶山技师学院）院内。主要提供民用建筑勘察设计，地质勘察，晒图，房屋租赁等业务。

2005年，办公地点搬至河南城建学院东校区行政楼。重整组织机构，下设：综合办、财务室、建筑设计所、结构设计所、设备设计所。

2006年，浅桩板钢筋砼桥梁基础获得国家级科技成果。

2009年，由河南城建学院（原平顶山工学院）批准成立河南城建学院规划设计研究院，属学校二级机构。具有建筑行业（建筑工程）乙级资质。

2011年，经河南省工商管理局核准成立河南城镇综合设计研究院。注册资金300万元。同年，办公场所搬至河南城建学院西校区院内。

2012年，成立“城镇综合设计研究院分工会”，隶属河南城建学院工会委员会。同年，设立造价咨询所、经营部。

2013至2016年，连续荣获“河南省工程勘察设计行业精神文明先进单位”称号。

2014年，设立市政设计所，原建筑设计所、结构设计所、设备设计所合并为“建筑与规划设计所”。

2016年，设立BIM工作室。

2017年，新增市政给水工程、排水工程、风景园林工程设计乙级资质。同年，获得河南省“匠心杯”工程建设BIM技术应用大赛三等奖。

2018年，新增市政道路工程、桥梁工程设计乙级资质，工程测量勘察乙级，城乡规划乙级资质。同年，设立测绘所、景观设计所。同年，荣获“2018年度平顶山市优秀工程勘察设计三等奖”。

2019年，设立生态环境设计所、电气与自控设计所。造价咨询所并入BIM中心。

2020年，取得排水管道检测与评估作业能力甲级资质、工程造价咨询企业乙级资质，并且通过质量管理体系、环境管理体系、职业健康安全管理体系认证。

2021年，取得建筑工程、市政工程监理乙级资质。

2021年，更名为河南城院卓越综合设计研究院有限公司。